ในสื่อที่มีฤทธิ์กัดกร่อนสูงส่วนใหญ่ เซอร์โคเนียมมีความต้านทานการกัดกร่อนได้ดีกว่าไทเทเนียม นี่คือสาเหตุที่วัสดุเซอร์โคเนียมมีราคาแพงกว่าวัสดุไทเทเนียม แต่ยังคงใช้ในอุปกรณ์เคมีหลายชนิด เนื่องจากเซอร์โคเนียมและแฮฟเนียมมักจะอยู่ร่วมกันในแร่เซอร์โคเนียม ปริมาณแฮฟเนียมในแร่เซอร์โคเนียมจึงอยู่ที่ประมาณ 2%-3% ของปริมาณเซอร์โคเนียม คุณสมบัติทางกายภาพและเคมีของเซอร์โคเนียมและแฮฟเนียมมีความคล้ายคลึงกันในทุกด้าน จำเป็นต้องได้รับแร่เซอร์โคเนียมซึ่งมีเซอร์โคเนียมและฮาฟเนียมอยู่ร่วมกัน ต้นทุนในการผลิตเซอร์โคเนียมที่มีปริมาณแฮฟเนียมน้อยกว่า 0.01% นั้นสูงและเนื่องจากคุณสมบัติทางกายภาพและทางเคมีของเซอร์โคเนียมและแฮฟเนียมมีความคล้ายคลึงกันมาก จึงไม่จำเป็นต้องลดปริมาณแฮฟเนียมในการผลิต เซอร์โคเนียมเกรดเคมี โดยทั่วไปปริมาณแฮฟเนียมในเซอร์โคเนียมจะไม่เกิน 4.5%
เซอร์โคเนียมยังเป็นโลหะที่ทำให้เกิดฟิล์มและสามารถรวมกับออกซิเจนได้อย่างง่ายดายเพื่อสร้างฟิล์มฟิล์มที่มีความหนาแน่นบนพื้นผิว ทำให้เซอร์โคเนียมทนต่อการกัดกร่อนจากกรดอินทรีย์ กรดอนินทรีย์ ด่างแก่ เกลือหลอมเหลว น้ำที่มีอุณหภูมิสูง และโลหะเหลวส่วนใหญ่ มีความต้านทานการกัดกร่อนที่ดีเยี่ยมในกรดไฮโดรคลอริกทุกความเข้มข้นต่ำกว่าจุดเดือดความดันปกติ แต่มีความเป็นไปได้ที่จะเกิดไฮโดรจิเนชันในกรดไฮโดรคลอริกที่สูงกว่า 149 องศา เซอร์โคเนียมสามารถใช้ในกรดไนตริกได้ที่อุณหภูมิต่ำกว่า 250 องศาและมีเศษส่วนมวลไม่เกิน 70% แต่มีแนวโน้มที่จะติดไฟในกรดไนตริกเข้มข้นที่มีปริมาณน้ำน้อยมาก เซอร์โคเนียมทนต่อการกัดกร่อนในกรดอินทรีย์ แต่ไม่ทนต่อการกัดกร่อนในกรดไฮโดรฟลูออริก กรดซัลฟิวริกเข้มข้น กรดฟอสฟอริกเข้มข้น น้ำกัดทอง น้ำโบรมีน กรดไฮโดรโบรมิก กรดฟลูออโรซิลิก แคลเซียมไฮโปคลอไรต์ และกรดฟลูออโรบอริก ไม่ทนต่อการกัดกร่อนในสารละลายออกซิไดซ์คลอไรด์ เช่น คอปเปอร์คลอไรด์และเฟอร์ริกคลอไรด์ แต่มีความทนทานต่อการกัดกร่อนในสารละลายคลอไรด์แบบรีดิวซ์
เมื่อเซอร์โคเนียมลอยอยู่ในอากาศ จะลอกอย่างรุนแรงที่ 425 องศา เกิดเซอร์โคเนียมออกไซด์สีขาวที่ 540 องศา และดูดซับออกซิเจนและเปราะเกิน 700 องศา เซอร์โคเนียมทำปฏิกิริยากับไนโตรเจนที่สูงกว่า 400 องศา และทำปฏิกิริยารุนแรงที่ประมาณ 800 องศา การหลอมด้วยสุญญากาศไม่สามารถกำจัดออกซิเจนและไนโตรเจนออกจากเซอร์โคเนียมได้ เซอร์โคเนียมเริ่มดูดซับไฮโดรเจนที่อุณหภูมิสูงกว่า 300 องศา ทำให้เกิดการเปราะของไฮโดรเจน ไฮโดรเจนสามารถกำจัดได้โดยการหลอมสุญญากาศที่อุณหภูมิ 1,000 องศา
